Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID4AP29374 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms