Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCAP28676 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCAP28676 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCAP28676 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCAP28676 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCAP28676 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCAP28676 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GCAP28676 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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