Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFX1P22670 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFX1P22670 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFX1P22670 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFX1P22670 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFX1P22670 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms