Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP4AP20648 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms