Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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