Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms