Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms