Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODC1P11926 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODC1P11926 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms