Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC099568.1-201ENST00000432395 509 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC006153.1-201ENST00000480135 371 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC087441.1-201ENST00000531069 301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 EAF1-AS1-205ENST00000595975 892 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL157392.5-201ENST00000601460 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms