Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C4BP0C0L5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C4BP0C0L5 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms