Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms