Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms