Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEP104O60308 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP104O60308 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP104O60308 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP104O60308 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms