Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALUO43852 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALUO43852 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALUO43852 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALUO43852 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALUO43852 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALUO43852 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALUO43852 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALUO43852 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALUO43852 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms