Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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