Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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