Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms