Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms