Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms