Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KLHL42Q9P2K6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms