Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BCO2Q9BYV7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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