Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms