Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms