Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSEN34Q9BSV6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms