Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCNX1Q96RV3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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