Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALPK3Q96L96 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms