Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms