Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SIRT1Q96EB6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SIRT1Q96EB6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms