Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMARCE1Q969G3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms