Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCG3Q8WXD2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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