Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNERQ8NFT8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms