Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TTC21AQ8NDW8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC21AQ8NDW8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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