Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM71DQ8N9W8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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FAM71DQ8N9W8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM71DQ8N9W8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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