Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACE1Q8IYU2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACE1Q8IYU2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACE1Q8IYU2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACE1Q8IYU2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACE1Q8IYU2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACE1Q8IYU2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACE1Q8IYU2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACE1Q8IYU2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms