Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECW1Q76N89 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms