Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BEND4Q6ZU67 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BEND4Q6ZU67 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms