Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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