Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP20-2Q3LI61 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms