Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWISTNBQ3B726 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms