Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

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Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ZNF827Q17R98 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF827Q17R98 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF827Q17R98 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF827Q17R98 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF827Q17R98 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF827Q17R98 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF827Q17R98 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF827Q17R98 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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