Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA3Q16787 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA3Q16787 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms