Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms