Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PUM3Q15397 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PUM3Q15397 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PUM3Q15397 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PUM3Q15397 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUM3Q15397 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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