Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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