Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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NCF4Q15080 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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