Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLD3Q15054 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms