Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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