Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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