Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTCH1Q13635 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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