Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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